如何让珊瑚颜色更多彩，第三部分——新资讯：荧光红：红色荧光蛋白类【转帖】

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呼啦圈扭曲效应（Hula Twist）:


色素细胞分子之间的化学键并未断裂，但颜色发生了明显变化。因此，色素的颜色可以来回转变，使人联想起呼啦圈舞动的颜色变化。


Kaede-type pigment:


一种红色荧光色素，能发出574-580纳米的荧光，二次激发情况下能够发出630纳米的荧光。最初是在硬骨珊瑚Trachyphyllia geoffroyi上发现了这种色素，但在Faviina的亚目中该色素更为常见。

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Kindling Protein:


一种能从无荧光效果的色素蛋白转化为具有荧光效果的色素蛋白质。有时被称为“Kindling Fluorescent Protein”或“KFP”


量子产额（Quantum Yield）:


激发光被吸收转换成荧光的产能。如果100个光子被吸收，50个光子作为荧光释放，量子产额就是0.50。

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退色（Photobleaching）:


有些色素，如Dronpa，在暴露在强光下会失去荧光（开始会变成绿色，最后在蓝绿色光下失去荧光）。退色会明显影响生物表明荧光性。多种色素都存在消退荧光的现象，最后导致表面颜色明显变化，甚至白化。


变色（Photoconversion）:


在光线的作用下，有色蛋白内部结构重新组合。根据蛋白的不同，变色也分为荧光增强和荧光减弱（增色或退色）。变色过程中，蛋白分子内部化学键变化，(as with Kaede and Eos fluorescent pigments)可形成永久变色或随光线变化而变色的呼啦圈扭曲效果的临时变色，就是大家常说的变色反应)。

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红色荧光蛋白，Red Fluorescent Protein (RFP):


能够发出570纳米或波长更长荧光的荧光蛋白。包括Ds-Red, Kaede以及Chromo-Red pigments.


斯托克司频移（Stokes Shift）:


激发光最长波长与荧光最长波长之间的差值。例如激发光最长波长508纳米，而发出荧光最长波长538纳米，斯托克司频移为27纳米。

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激发临界值（Threshold 或 Coloration Threshold）:


荧光物质被激发出明显可见的荧光时的临界值，或无荧光物质吸收光线的临界值。临界值一般与荧光产生有关，有时也用于判断荧光效果是否消失。（在判断退色和变色中使用）


黄色荧光蛋白（Yellow Fluorescent Protein）:


一种不常见的荧光蛋白，能发出525-570纳米的荧光。(Alieva et al., 2008).

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色素分类：


目前至少发现了9种珊瑚色素。某种红色或绿色可能在结构上与其它红色或绿色分支不同，包括：



青色荧光蛋白，Cyan Fluorescent Proteins (CFP) – 能发出蓝绿色荧光，波长范围小于500纳米。载色体结构与绿色荧光蛋白非常接近。

绿色荧光蛋白，Green Fluorescent Proteins (GFP) – 这个种类的荧光蛋白是最多的，而且其载色体结构与青色荧光蛋白载色体结构十分相似。

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黄色荧光蛋白，Yellow Fluorescent Proteins (YFP) – 一种不太常见的荧光蛋白，能发出黄色荧光。蕴含黄色荧光蛋白的生物也比较少，如zoanthid 和一些种类的硬骨珊瑚如Agaricia 。就我个人而言，身居夏威夷岛，我经常在夜间带上特殊装备潜水，观察这种特殊的荧光。www.nightsea.com有更详细的说明。

橙色荧光蛋白，Orange Fluorescent Protein (OFP) - OFP一般指从硬骨珊瑚Lobophyllia hemprichii 身上提取的色素，看名字好像是一种单独的蛋白种类。事实上，橙色荧光蛋白是Kaede-type 荧光蛋白的一个变种。

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红色荧光蛋白，Red Fluorescent Proteins (RFP) – 包含很多亚种，(如Kaede, Ds-Red 和 Chromo-Red)。典型的激发荧光波长在580纳米或更短，有时也会稍稍超过600纳米。

Dronpa – 一种绿色的荧光色素蛋白，当暴露在蓝绿色光（490纳米）下时失去荧光，但在光照提高到400纳米的紫色时，又会恢复荧光。

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Kindling Proteins – 这种蛋白色素（从海葵Anemonia sculata身上提取）可以从无荧光状态转化为具有可见荧光的状态。此反映是根据照射在色素上的光线波段范围发生变化，并且是可控制可逆的变化。

Chromo-Red Proteins – 2008年新分类出来的荧光蛋白色素，来源于硬骨珊瑚Echinophyllia。这种蛋白色素具有色素蛋白质的特性，又能发出最大波长609纳米的强列红色荧光。

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色素蛋白质Chromoproteins (CP) –这种类型的色素没有荧光反映，或荧光及其微弱，可以忽略。这些色素通过吸收光线中特定波长显色，而不是通过荧光反映着色。大多数的色素蛋白质吸收光线中560-593纳米范围内的光谱。也有报道称海葵能吸收的最大波长为610纳米，硬骨珊瑚吸收波长范围一般在480-500纳米范围内。有些色素蛋白质的结构与Ds-Red荧光蛋白色素结构十分相似。事实上，通过基因学研究发现，置换有色蛋白中的一个氨基酸就可以将其转化为荧光蛋白。大多数研究人员关注荧光蛋白，而不重视色素蛋白质，相关学术文章也只有40余篇。