对香港55个潜水地点进行的水下勘测显示，香港还有14科31种暗礁鱼类。包括 Acanthuridae, Chaetodontidae, Diodontidae, Gobiidae, Labridae, Mullidae, Nemipteridae, Pinguipedidae, Pomacanthidae, Pomacentridae, Ptereleotridae, Solenostomidae, Tetraodontidae and Tetrarogidae科属成员，均在调查中出现，但不排除人工放生的品种。

由于雨季和珠江流出物的影响，香港南海水域的盐度、营养物质和温度各不相同，但这些条件结合起来形成了生物多样性热点，吸引了热带和温带鱼类物种、咸水和微咸水。那里也有珊瑚，香港记录了中国海洋物种总数的26%，尽管香港仅占中国海洋总领土的0.03%。